TCD检查时，通过波形和超声信号来判断是否发生不正常现象。它的操作还需要有医生在了解了剖析大脑标志以及血管的路径之外，才能让操作者知道颅内的血管的走向和超声束之间的角度，这样便降低血流速度的准确性。
值得注意的是，国内外的学者利用经颅多普勒来检查患者，发现了他们的脑部的血液流动存在不正常的现象，脑动脉血流速度要比正常人明显慢得多。对比发现，患者以及神经患者和正常人相比较，他们的后动脉的血流速度升高，可是左侧的动脉血管的流速相对更低一些。
人体血液循环中出现的并随血流流动的某些异物，如凝血块、动脉粥样硬化斑脱落的碎斑块、脂肪组织及气泡等，都可成为微栓子，由于颗粒较红细胞体积大，故其超声信号更强，此为TCD监测微栓子基本的原理。与动脉狭窄严重性及斑块稳定性密切相关，因此，微栓子监测可预测高危人生卒中的危险性，为临床预防与治疗提供参考信息。
