经颅多普勒检查能够查出颅内病，可以用来诊断颅内血管阻塞，并诊断颅外是否发生血管阻塞的病变。并且，判断管病是否会对颅内的血流的流速造成影响，判断和跟踪探测颈内是否有动脉夹层动脉。同时，还能为鉴定静脉畸形而提供血动脉，评价一个支循环能力的体系等等。
目前已经知道临床许多疾病，如血管性、功能性头晕、眩晕、神经官能症、自主神经功能紊乱等均与脑血管功能紊乱有密切关系，经颅多普勒的检查对这类功能性疾病的病因学诊断有极重要的诊断价值，并可为临床治疗提供客观的依据。
TCD检查时，通过波形和超声信号来判断是否发生不正常现象。它的操作还需要有医生在了解了剖析大脑标志以及血管的路径之外，才能让操作者知道颅内的血管的走向和超声束之间的角度，这样便降低血流速度的准确性。
