TCD对于颅内血管狭窄、闭塞诊断的优势已经得到公认，但对于颈部血管病变的诊断、评估，同样有价值，尤其是对于颈总动脉或颈内动脉中度狭窄和重度狭窄的区分上，关系着治疗方案的选择和病情评估。仅仅依靠MRA或者颈部血管彩超应用形态学或者狭窄部位本身的血流速度来判断狭窄程度是不够科学的，必须通过狭窄部位远端有没有低搏动改变来判断，而TCD可以准确、简便的提供这项数据。
目前已经知道临床许多疾病，如血管性、功能性头晕、眩晕、神经官能症、自主神经功能紊乱等均与脑血管功能紊乱有密切关系，经颅多普勒的检查对这类功能性疾病的病因学诊断有极重要的诊断价值，并可为临床治疗提供客观的依据。
脑死亡时TCD频谱有特征性改变，提示脑循环停止。是脑死亡诊断三项确认手段之一。完善脑死亡诊断既减轻家庭和社会负担，又予以患者死亡的尊严，还能解决器官移植的供体来源。
